Le fortezze sono anche considerate patrimonio storico di Florianópolis.
Costruiti dai portoghesi quando il sud del Brasile era conteso da Portogallo e Spagna, i forti dell'isola di Santa Catarina costituivano un sistema difensivo per impedire l'invasione spagnola delle allora sconosciute terre del sud.
Le tre fortificazioni più importanti costruite in questo periodo furono:
Fortezza di Santa Cruz de Anhatomirim
Era la principale fortificazione dell'antico sistema difensivo dell'isola di Santa Catarina e si trova su una piccola isola nella baia settentrionale (Ilha de Anhatomirim).
Fortezza di Santo Antônio de Ratones
Situato anche su una piccola isola nella baia nord (Ilha de Ratones), funzionava come uno dei vertici del sistema di difesa triangolare della baia nord dell'isola di Santa Catarina.
Fortezza di São José da Ponta Grossa
L'unica delle grandi fortezze situate sull'isola di Santa Catarina, è teatro di uno degli scenari architettonici e paesaggistici più belli dell'isola.
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Successivamente furono costruite anche altre fortificazioni che si aggiunsero al sistema difensivo della regione, come la Forte di Nostra Signora della Concezione di Araçatuba, o Forte di Santa Bárbara da Vila, O Forte Marechal Moura di Naufragados e i punti di forza di Sant'Ana do Estreito e Santa Barbara da Vila.
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